Коноха:

уч. академии – дети с 7 до 10 лет, зачисляются по желанию родителей, обучаются простейшим навыкам ниндзя. Требуется неплохое здоровье для поступления в академию.
ниндзя-медики/отряд ниндзя-медиков – особое подразделение синоби, владеющих техниками исцеления и изготовке различных противоядий и лекарств, а также специфическими дзюцу. Набор в отряд производиться среди генинов и тюнинов с превосходным контролем чакры, после чего их начинают обучать по специальности. Членов отряда приписывают к тем или иным командам синоби для увеличение шансов успешного исхода задания, либо отправляют в госпиталь Конохи. Отряд сформирован после окончания войны для более эффективного использования человеческих ресурсов.
АНБУ – первоначально исполняли различнейшие функции, чаще концентрируясь на особо секретных заданиях. Сейчас представляют из себя особый блок для шпионажа. Набираются из самых надежных дзенинов селения.
Военная полиция Конохи – отряд, созданный Вторым Хокаге для защиты гражданского населения деревни. Первоначально состоял из членов клана Учиха, после восстановления деревни туда отбираются наиболее бесперспективные ниндзя-тюнины.
Ниндзя-охотники – набираются из тюнинов и дзенинов с высокими навыками как в разведке, так и в области медицины. Разыскивают и уничтожают нукеннинов.

Суна:

уч. академии – дети с 7 до 10 лет, зачисляются по желанию родителей, обучаются простейшим навыкам ниндзя. Требуется неплохое здоровье для поступления в академию.
медики – гражданские медики, владеющие основами знаний.
АНБУ - первоначально исполняли различнейшие функции, чаще концентрируясь на особо секретных заданиях. Сейчас представляют из себя особый блок для шпионажа. Набираются из самых надежных дзенинов селения.
Ниндзя-охотники – набираются из тюнинов и дзенинов с высокими навыками как в разведке, так и в области медицины. Разыскивают и уничтожают нукеннинов.
Отряд кукловодов – специальное подразделение Суны, которое специализируется на работе с марионетками и также является аналогом отрядов ниндзя-медиков Конохи. Кроме создания и управления марионетками, члены отряда изучают создание ядов, противоядий, а также множество медицинских дзюцу, хотя и не в полной мере. Набирают в отряд любых синоби, а также учеников академии, которые проявляют талант в области управления куклами, а также желание участвовать в исследованиях. Отряд элитный, используется на самых разнообразных заданиях. К другим командам ниндзя прикрепляется редко.

Аме:

уч. академии – дети с 7 до 10 лет, зачисляются по желанию родителей, обучаются простейшим навыкам ниндзя. Требуется неплохое здоровье для поступления в академию.
ниндзя-медики/отряд ниндзя-медиков – особое подразделение синоби, владеющих техниками исцеления и изготовке различных противоядий и лекарств, а также специфическими дзюцу. Набор в отряд производиться среди генинов и тюнинов с превосходным контролем чакры, после чего их начинают обучать по специальности. Членов отряда приписывают к тем или иным командам синоби для увеличение шансов успешного исхода задания, либо отправляют в госпиталь Аме. Отряд сформирован после окончания войны для более эффективного использования человеческих ресурсов.
АНБУ – первоначально исполняли различнейшие функции, чаще концентрируясь на особо секретных заданиях. Сейчас представляют из себя особый блок для шпионажа. Набираются из самых надежных дзенинов селения.
Ниндзя-охотники – набираются из тюнинов и дзенинов с высокими навыками как в разведке, так и в области медицины. Разыскивают и уничтожают нукеннинов.
Семеро мечников дождей – наследие уничтоженной Кири. Семеро синоби, с детства обучающихся владению огромными мечами. Используются для самых опасных заданий.